神奇仙子在艾菲城学院的第三学期开始了，她们必须在自己的家乡，靠着自己的力量为某人做出牺牲，得到了独特的变身能力，并成为超仙灵女（Enchantix），也就是真正的仙子。而也有新的成员那布(Nabu)，和新的敌人魔陀(Valtor)。